> 違う原因かと思いますがうちでも小塚明朝に変わる問題が発生しています。
> Win CS2で使用していますが外部デザイナーがMac CS2で組んだレイアウトの見出しゴの○付き数字を入力し直すと小塚明朝になってしまいます。
フォントによってはCMapの違いから(準拠しているユニコードの違いともいえますが)、当該のCID字形は実装されていてもユニコードと関連づけがされていない場合があります。
例えばご指摘のA-OTF 見出ゴMB31 Pro の場合は20(ユニコード2473/CID7574)までは大丈夫ですが、21(ユニコード3251/CID8091)以降はCIDとしては実装していますが、ユニコードとの関連づけがされていないのでダメです。
Pr5を使用すれば問題ないかと思います。