私も流星さんのおっしゃるとおり、Wordから取り込みInDesign上で正規表現検索置換を使います。
置換語句の確認は、置換側にに文字スタイル(太めの下線や文字色を変更したもの)を設定しておき、確認後にスタイルを削除すればいいと思います。
語句の統一が複数有るようでしたら、市川せうぞーさんのスクリプト「regex_continuous_substitution.jsx」を使うと一気に複数置換でき、文字スタイルもかけられます。
参考
http://d.hatena.ne.jp/seuzo/20080601
[15419] kin (2013/03/28 Thu 15:09)